Nhiều doanh nghiệp XNK vẫn
chưa nắm rõ quy trình thực hiện làm thủ
tục hải quan điện tử . Sau đây xin tóm tắt các bước cơ bản để thực hiện
thủ tục hải quan điện tử :
Bước thứ 1: Doanh
nghiệp thực hiện khai tờ khai
hải quan điện tử và tờ khai trị
giá (nếu cần) theo đúng tiêu chí và khuôn dạng chuẩn và gửi tới hệ thống của cơ
quan hải quan.
Bước thứ 2: Doanh
nghiệp nhận thông tin phản hồi từ cơ quan hải quan về số tờ khai hải quan, kết
quả phân luồng và thực hiện một trong các nội dung sau:
+ Luồng xanh: Miễn
kiểm tra hồ sơ giấy và miễn kiểm tra thực tế hàng hóa. Lô hàng được cơ quan hải
quan chấp nhận thông quan thì chuyển sang bước 4.
+ Luồng vàng: Kiểm tra
hồ sơ hải quan. Nếu được yêu cầu sửa
đổi, bổ sung hồ sơ hải quan thì doanh nghiệp thực hiện theo yêu cầu và xuất
trình hồ sơ giấy để cơ quan hải quan kiểm tra. Nếu lô hàng được chấp nhận thông
quan thì thực hiện tiếp bước 4, nếu cơ quan hải quan yêu cầu kiểm tra thực tế
hàng hóa thì chuyển sang bước 3.
Bước 3: - Luồng đỏ:
Doanh nghiệp xuất trình hồ sơ giấy và hàng hóa để cơ quan hải quan kiểm tra.
Bước 4: Doanh nghiệp
in tờ khai trên hệ thống của mình để đi lấy hàng.
Doanh nghiệp được sử
dụng tờ khai điện tử in từ hệ thống của doanh nghiệp, có chữ ký số và đóng dấu của doanh nghiệp thay cho tờ khai
giấy và các chứng từ kèm theo để đi nhận hàng và làm chứng từ vận chuyển hàng
hóa trên đường (nếu lô hàng thuộc diện được miễn kiểm tra hồ sơ giấy và miễn
kiểm tra thực tế hàng hóa).
Khi doanh nghiệp nộp
tờ khai thuế, ngay lập tức hệ thống tự động gửi thông báo trên mail của doanh
nghiệp đã cung cấp cho cơ quan thuế. Nội dung thông báo gồm có ngày, giờ cơ
quan thuế đã nhận tờ khai, loại tờ khai, trạng thái tờ khai, kỳ kê khai và số
lần nộp. Trên thông báo có chữ ký số của cơ quan thuế (Tổng cục Thuế). Thông
báo có chữ ký số của cơ quan Thuế gửi đến mail của doanh nghiệp là văn bản có
tính pháp lý cao xác định thời hạn doanh nghiệp gửi hồ sơ kê khai thủ tục hải quan.